تتكون الكلية من أربعة أقسام، هي:

  ‌أ-      قسم العلوم الأساسية

 ‌ ب-    قسم الجيولوجيا والاستكشاف البترولي

‌  ج-     قسم  هندسة الحفر

  ‌د-      قسم هندسة المخزون والإنتاج  

- يمنح مجلس الجامعة السورية الخاصة بناءً على اقتراح مجلس كلية هندسة البترول فيها، درجة الإجازة في هندسة البترول.