1 – قسم الكيمياء الصيدلية والمراقبة الدوائيةPHCC: ويتبع له المقررات التالية :

 الكيمياء العامة واللاعضوية – الكيمياء العضوية الصيدلانية  (1 ، 2 ) – التخليق الدوائي – الكيمياء الصيدلية ( 1 ، 2) – الكيمياء الدوائية : تصميم الدواء  - مراقبة الأدوية – مواد صيدلانية مُشعَة.

2 – قسم الصيدلانيات والتكنولوجيا الصيدلانيةPHPT : ويتبع له المقررات التالية :

المدخل الى علم الصيدلة – الصيدلانيات ( 1 ، 2 ) – التكنولوجيا الصيدلانية – الصيدلة الصناعية – الصيدلة الحيوية وحرائك الدواء – الصيدلة السريرية وصيدلية المستشفيات – مستحضرات التجميل - الحسابات الصيدلانية.

3 – قسم علم الادوية والسموم  PHPP: ويتبع له المقررات التالية :

 فيزيولوجيا وفيزيولوجيا مرضية - علم الأدوية ( 1 ، 2 ) – علم الأدوية الجزيئي  - علم السموم – سموم تطبيقية وشرعية .

4 – قسم العقاقير  PHPC : ويتبع له المقررات التالية :

  بيولوجيا نباتية – العقاقير ( 1، 2 ) – كيمياء العقاقير – عقاقير تطبيقية.

5- قسم الكيمياء الحيوية والميكروبيولوجيا PHBM : ويتبع له المقررات التالية :

بيولوجيا حيوانية – الكيمياء الحيوية  العامة ( 1 ، 2 ) – الكيمياء الحيوية السريرية – الجراثيم والفيروسات – الطفيليات والفطريات – دمويات ومناعيات – البيولوجيا الجزيئية – هندسة وراثية – اللقاحات والمواد البيولوجية المُمَنّعة .

6 – قسم الكيمياء التحليلية والغذائيةPHAC: ويتبع له المقررات التالية:

الكيمياء التحليلية الصيدلانية ( 1 ، 2 ) – التحليل الالي – الصيدلة الفيزيائية -  الكيمياء الغذائية

 تشترك الأقسام المختلفة في الكلية وفي الجامعة بتدريس المقررات التالية:

تشريح ونسج – الإسعاف – الأمراض – التقانة الحيوية في الصيدلة –تلوث بيئة ووبائيات – تاريخ وآداب وقوانين الصيدلة – ترويج وتسويق واقتصاد صيدلاني – تغذية وحميات – الصيدلة الجرثومية – مقدمة في تطبيقات الحاسوب – اللغة الانجليزية ( 1،2،3 ) –السلوك النفسي – المنطق ( التفكير ) العلمي – الإحصاء الحيوي – مصطلحات صيدلانية باللغة الانجليزية – الإنشاء العلمي باللغة الانجليزية – لغة أجنبية ثانية – الرياضيات – الفيزياء – مهارات تواصل – اللغة العربية – ضمان الجودة في الصيدلة – الملازمة - مشروع التخرج .